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水稻黄叶突变体的生理分析与基因定位(3)
(8)加40-100µlTE缓冲液或灭菌的双蒸水溶解DNA。
(9) 测DNA浓度。
1.3.2 分子定位与基因定位
选择均匀分布于12条染色体上的135对SSR和Indel标记,在yl1/窄叶青8号F2群体中选出10株黄叶个体,与两个亲本一同进行PCR扩增及聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,找出与黄叶表型基因连锁的标记,通过标记的筛选可将目标基因定位于某条染色体上,再用该连锁标记及其附近的标记对F2中的黄叶个体进行连锁验证,从而将目标基因确定在比较具体的某一区间上。
1.3.2.1 PCR反应
(1)PCR反应体系(25µl)
cDNA(10ng/µl) 2.0µl
Primer (2pmol/µl) 1.0µl
10×Bufferfree (MgCl2)
dNTP(2.5mM)MgCl2 (25mM)
11µl
Taq (5u/µl) 0.25µl
ddH2O 11µl
总体积 25µl
(2)PCR反应程序
PCR反应参考Chen等的方法[7] ,略作改动。
step1 95℃ 5min
step2 95℃ 30sec
step3 55℃ 30sec
step4 72℃ 30sec
step5 go to step2 34cycles
step6 72℃ 5min
step7 10℃ 保存
1.3.2.2 PCR产物的检测
(1) 聚丙烯酰胺凝胶电泳
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