甘薯全基因组范围内转录本可变剪接的初步分析(3)
图 1 pre-mRNA剪接反应示意图。
Fig 1. The schematic diagram of RNA splicing reaction.
1.2.3 可变剪接的基本类型
最近几年生物信息学已成为生物学领域的研究热点之一，每年世界各大期刊都有大量的研究成果，但是导致可变剪接的精确机制还没有研究透彻，可变剪接的分类也存在多种方式。综合来看，根据主要的可变剪接转录本(AS isoform)，可变剪接可划分为四种基本类型：盒式可变剪接，5’端可变剪接，3’端可变剪接，内含子保留。[9]
① 盒式可变剪接(exon skipping, ES或cassette exon):是指在发生可变剪接的某基因其中一个转录本的某些外显子整体存在(exon inclusion)或整体缺失(exon exclusion)的现象。
② 5’端可变剪接(5' alternative splicing)或称可变的供体剪接位点(alternative donor introns, AD):具有竞争的供体(5’端)剪接位点，而内含子下游的受体位点相同。[10]
③ 3’端可变剪接(3' alternative splicing)或称可变受体剪接位点(alternative acceptor introns, AA):具有竞争的受体(3’端)剪接位点，而内含子上游的供体位点相同。[10]
④ 内含子保留可变剪接(intron retention, IR):是指一段核苷酸序列在部分转录本中是某外显子的一部分，而在其他转录本中成为内含子的现象。[11]
下一篇：亚精胺对黄瓜根抗旱性的影响