蓖麻MFT基因家族生物信息学分析(3)
4.2蓖麻及其他物种MFT基因家族成员及相关信息
MFT-like亚族属于PEBP基因家族的成员之一，在之前的研究中，除了蓖麻之外，已经得到葡萄、拟南芥、草莓、小桐子、花生、玉米、小麦等等物种的MFT类基因家族的序列，详细信息请见下表（表1）。
表1 蓖麻与其它物种MFT类基因家族相关信息
物种名称 物种拉丁学名 基因名称 NCBI登录号 编码蛋白长度
蓖麻 Ricinus communis L RcPEBP1 XP002510818.1 169
RcPEBP2 XP00252873.1 173
RcPEBP3 XP002524698.1 161
RcPEBP4 XP002514784.1 174
RcPEBP5 XP002528554.1 173
葡萄 Vitis vinifera VvMFT NM_001281006.1 175
玉米 Zea mays ZmMFT NM_001159241.1 171
草莓 Fragaria x ananassa FaMFT KM435239 172
花生 Arachis hypogaea AhMFT JQ071509 176
小麦 Triticum aestivum TaMFT AB571513 175
拟南芥 Arabidopsis thaliana AtMFT AF147721 173
小桐子 Jatropha carcas JcMFT1 KJ130143 172
小桐子 Jatropha carcas JcMFT2 KJ130144 175
一粒小麦 Triticum monococcum TmMFT AB456687 175
4.3蓖麻MFT基因家族保守位点分析
根据之前的研究可以知道，与FT蛋白的Tyr和TFL1蛋白的His 氨基酸位点不同，MFT 类蛋白在类似的位点为保守的 Trp氨基酸， 如下图（图2）所示，第一个红色箭头所指示的氨基酸，同时，在 MFT 类蛋白的 C 端，也有一个保守的 Pro 位点，如下图所示第二个红色箭头所示，但是在 FT 类蛋白和 TFL1 类蛋白中则没有这个 Pro 位点，这暗示着在植物发育过程中，MFT蛋白可能发挥着与FT、TFL1不一样的功能[8]。从下图的保守位点分析结果中，我们可以知道，RcMFT3既具有保守的Trp又具有Pro位点，而RcPEBP1、RcPEBP2、RcPEBP4、RcPEBP5仅仅具有一个保守的Trp氨基酸位点，因此可以确定正确的蓖麻MFT序列应该是RcPEBP3，而不是其他四个序列。
此外，由下面的MFT类蛋白序列比对结果可以得知，MFT蛋白与小麦、拟南芥、玉米、花生、草莓等的MFT蛋白的序列一致度相当高，可以推测出MFT类蛋白在植物界是一类比较保守的蛋白质。