2材料与方法文献综述

2。1玉米BRXL基因的系统鉴定

从Pfam数据库（http://pfam。xfam。org/）下载BRXL结构域一致性序列，在玉米遗传学和基因组学数据库（MaizeGDB, http://www。maizegdb。org）中比对搜索，得到候选蛋白。搜索参数设置为E≤10-5。利用SMART工具对候选蛋白进行检索，若存在BRXL结构域，则认为属于BRXL家族。利用Protparam 软件(http://expasyorg/tools/ protparam。html)计算蛋白质等电点、氨基酸数目、分子量等参数，采用WoLF PSORT（http://www。genscript。com/psort/wolf_psort。html）预测蛋白质亚细胞定位。

2。2染色体分布和基因复制分析

 根据玉米BRXL的座位信息，利用Mapchart软件绘制染色体分布图。通过检索植物基因组复制数据库（PGDD, http://chibba。agtec。uga。edu/duplication/index/locus）查找玉米BRXL的片段复制事件。若两个基因间隔不超过5个基因，则认为起源于串联重复。

2。3系统发育分析

利用MEGA 5。1软件对玉米BRXL进行多序列比对，采用邻接法构建系统发育树，Bootstrap重抽样进行了1000次。

2。4基因表达分析

通过检索PLEXdb数据库（http://www。plexdb。org/plex。php?database=Corn）获取玉米BRXL基因的芯片表达数据，利用ClUSTER3。0软件绘制基因表达热图。

3结果与分析来!自-优.尔,论:文+网www.youerw.com

3。1玉米基因组中的BRXL基因

通过在MaizeGDB数据库中检索，除去重复序列和不含完整BRXL结构域的序列，最终鉴定出玉米基因组中17个BRXL基因。根据染色体位置系统命名为ZmBRXL1~ZmBRXL17。ZmBRXL外显子数差别较大：最少的为ZmBRXL12，有2个外显子，最多的是ZmBRXL11，有22个外显子。蛋白质氨基酸数从127~1131不等。理论等电点为4。67~10。05，其中ZmBRXL1，ZmBRXL2，ZmBRXL5，ZmBRXL6，ZmBRX8，ZmBRX11，ZmBRX14为酸性蛋白，ZmBRXL12为近中性蛋白，其余为碱性蛋白。亚细胞定位分析表明，ZmBRXL主要分布在细胞核中，少数分布在线粒体和叶绿体内。