2。2。2 重叠PCR连接cel3c与Pact(Pact - cel3c)
重叠PCR过程中,Pact的引物cel3c-Act-R设计时要比Xbal-F长,cel3c-Act-R设计时要比cel3c-R长,因为cel3c-Act-R引物上要有启动子相关序列,Xbal-F引物具有目的基因相关序列,在Xbal-F和cel3c-R的作用下,由于采用了具有互补末端的引物,使PCR产物形成了重叠链,通过重叠链的延伸,将不同来源的扩增片段重叠拼叠起来。
重叠PCR的方法为:取过柱回收的cel3c DNA 1L和Pact的DNA 2µL加入PCR体系中,加入Xbal-F、cel3c-R、T4DNA Ligase,将退火时间改为2min15s,其他均与启动子PCR体系程序相同。重复多次,将产物进行电泳,然后切胶回收。测其回收Pact-cel3c的DNA浓度。
2。2。3 Pact-cel3c-与载体(pCAMBIA-1300)的连接
1。 Pact-cel3c-的酶切
由于Pact-cel3c-的两端和pCAMBIA-1300上都含有XbaⅠ和HindⅢ的酶切位点,而且后面的克隆也要用到这两种酶,所以选择了XbaⅠ和HindⅢ这两种酶。用XbaI和HindⅢ这两种酶,将目的基因(包含启动子)切出粘性末端,以便于与载体连接。
根据说明书配置体系,体系体积根据酶切DNA的量决定。双酶切的Buffer选择根据说明书选择适合两种酶的Buffer,最后选择Tango buffer。酶切体系(40µL):8 µL的H2O、4 µL的10×Tango buffer,27µL的cel1a-Pact,0。5µL的XbaⅠ,0。5µL 的HindⅢ。酶切步骤:将酶切体系放入37℃中水浴3h,之后琼脂糖电凝胶电泳。切胶回收,测量其浓度。
2。质粒的酶切
(1)质粒DNA的提取
实验前一天晚,挑取大肠杆菌单个菌落至LB培养基(卡那霉素浓度为100µg/ml),37℃振荡培养过夜(12-16h)。第二天将培养物加入至2ml 离心管中,离心,9000r,1min,弃清液。向沉淀中加入150LP1,移至旋涡混合仪上,直至沉淀溶解。加入150LP2,轻摇。加入150LP3,混合摇匀。离心,1300r,6min,吸取420L清液,加入1ml无水乙醇,再离心,1300r,6min。倒出液体,离心,1300r,1min,打开盖子,放入烘箱内,烘干10min。加入25L含有RNA酶的TER溶液,弹一下,离心,1300r,1min。置于30℃恒温箱中,10min。加入1mlSolution PB,吸取700l溶液,离心,8000r,30s,倒滤液,重复离心2次。加入洗涤缓冲液700L,离心,8000r,30s,倒滤液,重复离心2次。空离2min,晾2min。将制备管放在干净的1。5ml离心管中,在制备膜中央加50LTER,静置1min,9000r离心1min洗脱DNA。吸取管底的TER,再重复一次离心步骤。放在4°C冰箱备用。文献综述
(2)质粒DNA的酶切
用XbaⅠ和HindⅢ进行双酶切,可与Pact-cel3c产生产生相同粘性末端,因此可以在连接体系中连接在一起。酶切体系(40µL)为:31µL的H2O、4 µL的10×buffer,4µL的质粒DNA,0。5µL的XbaI,0。5µL 的HindⅢ,酶切后电泳鉴定。然后进行切胶回收,测量回收DNA浓度。
3。 Pact-cel3c与pCAMBIA-1300的连接
连接体系(20 µL)为2。5µL H2O 、2µL的10×T4 DNA Ligase buffer、3µL的质粒载体、12 µL的目的片段 、0。5µL的 T4 DNA Ligase将上述体系置于22°C水浴锅中1h。
2。2。4 重组子导入大肠杆菌感受态细胞
将20µL连接体系、100µL大肠杆菌感受态细胞和30µLBuf,置于冰上30min。再转移到水浴锅中,42℃水浴80s,然后转到冰上2min。在无菌操作台中加入无抗生素的LB液体培养基 800µL于管中,37℃摇床1h后,7000rpm/min离心3min。移走上清800µL,用黄枪头重悬,混匀,最后涂平板。12-18小时后观察平板。
2。2。5 重组子的酶切