5)加入等体积的苯酚/氯仿/异戊醇((v:v:v=25:24:1),振荡混匀(避免剧烈振荡)。
6) 9000 rpm,4℃离心10 min,取上清液于新管中。
7)加入等体积的氯仿/异戊醇(v:v=24:1),颠倒混匀。
8)将混合液12000 rpm,4℃离心10 min, 取上清液于新管中。
9)加入已在-20℃中预冷的无水乙醇(加入量为上清液2倍体积),混匀,并在-20℃冰箱中静置1-2 h。
10)在4℃冷冻离心机中1000 rpm离心10 min,弃去上清。
11)使用10m1 70%乙醇洗涤5次,洗涤后在1000 rpm下离心5min,保留沉淀,并于空气中干燥。
12)干燥后加入400ul双蒸水溶解DNA,并于37℃培养箱中加入1ul的10mg/ml, ribonuclease solution (RNase)温育1h以上。
1。2。5 DNA电泳方法
1)1%琼脂糖凝胶的制备:称取适量琼脂糖粉末置于合适大小的三角瓶中,加入适量1xTAE缓冲液,于微波炉内反复沸腾,待冷却后注入已插上电泳梳的电泳版,待凝胶完全凝固后拔去梳子置于4度冰箱待用。
2)DNA样品的加入:首先将电泳板置于注入适量1xTAE缓冲液的电泳槽中,将DNA样品混合液(混有适量DNA上样缓冲液加入电泳板的点样孔,靠近负极的一侧为加样孔,加样完毕后以200V左右的电压电泳30 min左右。
3)DNA条带的成像:电泳结束后小心得将凝胶置于盛有适当浓度的EB溶液中,浸泡超过10 min后于Tanon 2500成像系统中在紫外光下观察DNA条带。
1。2。6 大肠杆菌的转化
1)于-70℃冰箱中取出大肠杆菌感受态并置于冰上5min解冻。
2)于解冻的大肠杆菌感受态100ul中,加入待10ul转化片段,缓慢摇匀后冰上放置30min。
3)将大肠杆菌感受态于42℃热激90s后,将其迅速将置于冰上2min。
4)向置于冰上的感受态中加入800ul LB液体培养基,于37℃摇床中150rpm培养1h左右。
5)将培养好的菌液12000rpm离心2min,用移液器移去400ul,保留的菌液摇匀并用涂布棒均匀涂布于含有抗生素的培养平板上,于37℃培养箱中培养12-24h。
6)挑取平板上的单克隆,用加有相应抗生素的LB液体液摇培养,待PCR鉴定阳性克隆。
1。2。7质粒的提取方法文献综述
Omega质粒提取试剂盒D6943-01购买于南京丁贝生物基因技术有限公司:
1)取2 ml左右过夜培养的含有相应质粒的菌液于2 ml离心管中,12000 rpm离心1min后弃去上清并将离心管倒扣与吸水纸上;
2)加入含有RNase A的Solution1 100ul,悬浮离心管中的细菌沉淀,用涡旋仪震荡混匀该悬浮液;
3)加入Solution2 250ul;后缓慢得上下颠倒混匀,使悬浊液形成透亮均一的溶液。
4)加入Solution3 350ul,缓慢得上下颠倒混匀产生白色沉淀后,12000rpm,离心10min
5)将离心管中的上清液加入质粒吸附柱中静置5 min后12000 rpm离心1 min;
6)弃滤液,加入HBC buffer 500ul,12000rpm,离心1min;
7)弃滤液,加入700ul Washing Buffer ,12000rpm,离心1min。
8)重复步骤7。
9)弃滤液,13200rpm,将空的管子离心3min。
10)将质粒吸附柱放入新的离心管中,室温晾干10 min后,在质粒吸附柱的膜中央加入65℃加热的50-60ul Elution Buffer,静置2 min后12000 rpm离心3 min,所得的液体于4℃或者-20℃保存。
1。2。8质粒酶切
1)酶切体系:
10xbuffer 1 ul
质粒 3 ul
Restriction enzyme 0。6 ul
加ddH20至 10 ul
2)用移液器吸打混匀;
3)于37℃金属浴中温育3-4h左右;
4)取3ul左右进行琼脂糖凝胶电泳观察质粒或者DNA的酶切情况;