2.3.3引物的设计与合成
本实验所用的引物是参照GenBank上已发表的绵羊TGFBR2基因序列(Accession No.:NC_022314.1),由上海生工借助 Primer premier 5.0软件设计并合成的。P1、P2、P3、P4引物分别扩增的是外显子2、外显子3、外显子4和外显子5。
根据上述基因序列,我们共设计了4对引物(P1、P2、P3、P4),引物序列、所扩增片段的大小和退火温度等见表2-2。
表2-2 TGFBR2基因PCR扩增引物序列
Table 2-2 Primer sequences for PCR amplification of TGFBR2 gene
引物
Primers 引物序列(5’→3’)
Sequence of primers 扩增片段大小
Product size 退火温度
Temperature
P4 F: 5 '- TCATCTGGCATCGCATCGTA - 3'
R: 5' - GGACAGATGCCAAAGAGACGA -3'
F: 5' - GAGCTGTGAGTGACGGGAG - 3'
R: 5'- CCGACCCTGTCACCCCTTA - 3'
F: 5' - TGTGCTGATGGGG来*自-优=尔,论:文+网www.youerw.com CACA - 3'
R: 5'- TGGATGAGGTCAGAGTGCAGG - 3'
F: 5'- GGCCTCTGTGTGTGTTCTTCT - 3'
R: 5'- CTGTATCCCTGAACTCGTGC - 3' 350 bp
2.3.4 PCR扩增及检测
2.3.4.1 PCR反应体系
本实验选用了汇集有Taq DNA聚合酶、dNTPs、镁离子和缓冲溶液的PCR混合液,和传统加样方法相比,此操作过程更快速简便,取样的误差降低了。此外由于混合液中加入了PCR所用的增强剂、优化剂等,使PCR反应特异性增强,灵敏度显著提高,扩增结果也更精准。